軒轅劍外傳漢之云這次的劇情發(fā)生在三國時(shí)代初年，大漢丞相諸葛亮在數(shù)年的休息生養(yǎng)、累積國力之后，毅然決定利用魏帝曹丕新喪、洛陽人心不安之機(jī)，展開北伐復(fù)興大業(yè)。自紀(jì)元二二八年起，諸葛亮連年發(fā)動(dòng)北伐攻勢，揮師祁山，襲逼關(guān)右。然而大魏的年輕皇帝曹叡御駕親征，調(diào)度井然，超乎所有人意料之外，因而魏師上下一心，將帥用命，漢軍前鋒攻勢先后為魏軍之宿將張郃、郝昭等人所遏阻，諸葛亮千里揮師，卻再三折兵損將，屢屢無功而退。

就在此時(shí)，漢軍中突然出現(xiàn)一支來歷不詳、身份神秘之奇兵部隊(duì)“飛羽”，他們從旁暗中協(xié)助漢軍作戰(zhàn)，雖然人數(shù)不多，但卻人人實(shí)力非凡，以一抵百，因而屢建奇功。包含丞相諸葛亮在內(nèi)，漢師全軍上下無人知悉“飛羽”真實(shí)底細(xì)，只知他們并不隸屬任何正規(guī)部隊(duì)，也不受漢軍正式號(hào)令所節(jié)制，但正也因?yàn)槿绱?，反能在正?guī)調(diào)度之外靈活作戰(zhàn)，不斷以奇襲立功。

在“飛羽”掩護(hù)下，漢將陳式順利奪下敵國之武都郡，這是北伐多次以來，首次獲得寶貴大捷！諸葛亮決心在此基礎(chǔ)上，進(jìn)一步發(fā)動(dòng)第四次北伐，希望順勢略取隴右。紀(jì)元二三一年，他親率主力部隊(duì)進(jìn)抵祁山，然而此時(shí)等在他們面前的對手，乃是剛移防至此地之新任大魏都督 司馬懿。諸葛亮未料與己第一次交手之司馬懿，竟一眼看穿他們在艱險(xiǎn)蜀道上糧運(yùn)之不易，因此故意采取堅(jiān)壁戰(zhàn)術(shù)，意圖讓漢軍自己糧盡而退，再趁勢追擊！

為了遏止司馬懿的陰謀，“飛羽”決定再次出擊！然而此時(shí)此刻誰也沒有想到，此一為重重神秘面紗所包圍的“飛羽”奇兵部隊(duì)，在不久的未來，卻將左右整個(gè)大漢之命運(yùn)……。